病原生物学与免疫学系是由原微生物学与免疫学教研室、寄生虫教研室于2013年合并而来。2024年，病原生物学与免疫学教师团队获首届“广东药科大学优秀教师团队”称号。2025年，系部所在的基础医学院教工第四党支部入选广东省第五批新时代高校党建“双创”工作样板党支部培育创建单位。系部现有教职员工17人，正高职称4人、副高职称6人；博士生导师2名、硕士研究生导师10名；5人入选广东省教育厅“千百十工程”培养对象、1名教师被列入“广东省高等学校优秀青年教师培养计划对象”、1名教师入选“广东药科大学青年强药学者”。

教育教学工作方面，承担全校本科生《医学微生物学》、《医学免疫学》、《病原生物学》、《微生物学与免疫学》、《人体寄生虫学》等基础课的教学工作，面向大学城、中山和云浮三校区五校园20个专业本科生进行授课。近年来，主编或参编教材12部，获得各级教学研究课题30余项，发表教学研究论文40余篇，获得省级教学成果奖二等奖1项、校级教学成果三等奖2项；人体寄生虫学被评为省级精品课程，医学免疫学被评为校级精品课程，微生物与免疫学被评为校级一流本科课程。

作为病原生物学、免疫学两个二级学科硕士学位授权点，为全校硕士研究生开设有高级免疫学、高级微生物学、抗体工程与抗体应用等课程。目前累计招收硕士研究生100余人，其中20多人获得省、校级优秀硕士论文。

科研工作方面，累计获得包括国家自然科学基金在内各类基金资助课题50余项，发表研究论文200余篇，其中被SCI等收录60余篇，获得授权专利8项，获广东省自然科学二等奖1项、广东省科学进步奖一等奖1项、国际埃尼奖(Eni Award)候选提名1项。